对于有无菌要求和常被细菌污染的房间（如手术室），有必要对空气进行灭菌处理，灭菌方法有以下几种：
细菌单体大小约在0.5~5μm之间,病毒大小约在0.003~0.5μm之间，它们在空气中不是以单体，而是以群体存在。这些微小的群体（范围大约1~μm）大多附着在尘粒上，因此在对空气进行净化的同时，细菌也被除掉了。因此，过滤法对于消灭室内的细菌和病毒是地分有效的。
当空气被加热到250~300℃时，细菌就会死亡。在空调系统中一般电加热器加热，但是由于使空气再冷却的费用高，故较少采用
3、紫外线灭菌法
紫外线具有较强的灭菌能力，凡紫外线所照之处，细菌都不能存活，具体方法是：在确保房间内无人后，将紫外线灯泡放在房间或风道内，进行直接照射杀菌，照射的强度和时间，可根据空气污染的程度和细菌类别来确定。
4、喷药法
直接在室内或送风管中喷杀菌剂灭菌，氧化乙烯等杀菌效果较好，但杀菌剂本身有强烈的刺激性气味，对人体健康不利，而且还会腐蚀金属，使用时要特别注意。
二、对空气的除臭处理
臭味的来源很多，有生产过程或产品散发出来的、民用建筑内人体散发出的臭味和烟雾提刺激性气味等，空气调节中较为有效的除臭法有通风法、洗涤法和吸附法。
以无臭味空气送入室内来冲淡或替换有臭味道的空气，例如在厨房、休息室设置排风充施，使卫生间内保持负压，避免臭味道散入其他的房间。
2、洗涤法
在空调工程中，对空气进行热湿处理的喷水室，可除去有臭虫味的气体或尘粒。
3、吸附法
吸附法主要靠吸附剂来吸附臭味或有毒气体、蒸汽和其他有机物质。
常用的空气的除臭装置―活性炭吸附器
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